O início do desbravamento do atual território dos municípios de Itaguaí, Seropédica e Paracambi data de meados do século XVII. Os jesuítas lançaram as bases da futura povoação em terras compreendidas entre os Rios Tiguaçu e Itaguaí, para catequizar os índios da região. Posteriormente, os missionários verificaram que as terras da Fazenda de Santa Cruz, mais próximas do mar, melhor se prestavam para aldeamento, para lá se transferindo com os índios, onde erigiram um templo dedicado a São Francisco Xavier, inaugurado em 1729, futura Itaguaí.

Em 1818, a aldeia de Itaguaí foi elevada à categoria de vila, com a denominação de Vila de São Francisco Xavier de Itaguaí, cujo município foi desmembrado de territórios do Rio de Janeiro e de Angra dos Reis.

A agem da antiga rodovia Rio São Paulo pelo território do antigo distrito de Seropédica, a instalação da indústria têxtil no antigo distrito de Paracambi, aliadas às obras de saneamento da Baixada Fluminense, empreendida por Nilo Peçanha, que permitiram o aproveitamento de grandes áreas, possibilitaram ao município readquirir sua antiga posição de prestígio.

Em 1938, foram iniciadas, em Seropédica, as obras do Centro Nacional de Estudos e Pesquisas Agronômicas, onde hoje funciona a Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. UFRRJ.

Em 1948, com a transferência do campus da UFRRJ para as margens da antiga rodovia Rio São Paulo, hoje BR-465, iniciou-se o desenvolvimento urbano de Seropédica.

O topônimo advém de um neologismo formado por duas palavras: uma, de origem latina, sericeo ou serico, que significa seda, e outra, grega, pais ou paidós, que significa tratar ou consertar. Um local, portanto, onde se trata ou se fabrica seda.

Formação istrativa c1r31

Distrito criado com a denominação de Bananal pela Lei Provincial n.º 549, de 30-08-1851, e pelos Decretos Estaduais n.º 1, de 08-05-1892, e n.º 1-A, de 03-06-1892, subordinado ao município de Itaguaí.

Em divisão istrativa referente ao ano de 1911 o distrito de Bananal figura no município de Itaguaí.

Pela Lei Estadual n.º 1.801, de 08-01-1924, o distrito de Bananal ou a denominar-se Padioba.

Nos quadros de apuração de Recenseamento Geral de 1-IX-1920, o distrito já denominado Padioba figura no município de Itaguaí.

Pela Lei Estadual n.º 2.069, de 29-11-1926, o distrito de Padioba ou a denominar-se Seropédica.

Em divisão territorial datada de I-VII-1960 o distrito de Seropédica figura no município de Itaguaí.

Elevado à categoria de município com a denominação de Seropédica pela Lei Estadual n.º 2.446, de 12-10-1995, sendo desmembrado de Itaguaí. Sede no antigo distrito de Seropédica. Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1997.

Em divisão territorial datada de 1-VII-1997 o município é constituído do distrito sede.

Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2015.